GoogleAdMobAdsSdkからgradleのAdMobに変更する

最初にbuild.gradle内のcompile files('libs/GoogleAdMobAdsSdk-6.4.1.jar')を消去。

プロジェクトのbuild.gradleのdependenciesに以下を追加

dependencies {
  // something
  compile 'com.google.android.gms:play-services:8.1.0'
}

ついで同ファイルの最初に以下を追加

apply plugin: 'com.google.gms.google-services'

更に全体のプロジェクトファイルを統括する（？）build.gradleに以下を追加

dependencies {
    classpath 'com.android.tools.build:gradle:1.3.0'
    classpath 'com.google.gms:google-services:1.3.+'
}

最後にAndroidManifest.xml内の内に以下を追加

    <meta-data android:name="com.google.android.gms.version"
        android:value="@integer/google_play_services_version" />

        <activity android:name="com.google.android.gms.ads.AdActivity"
            android:configChanges="keyboard|keyboardHidden|orientation|screenLayout|uiMode|screenSize|smallestScreenSize"/>

とりあえずこれでコンパイルエラーが変わると思います。